교회에서의 종교인소득 관련 궁금증

교회에서는 종교인소득을 신고할 때, 매년 2~3월에 받는 지급명세서를 세무서에 제출해왔습니다. 그러나 최근 연말정산만 하다가 종합소득세 신고를 놓치고 있었던 것 같습니다. 교회는 작은 개척교회이고, 목사님은 근로를 하시고 저는 교회행정을 도우며 종교인세제도에 대해 잘 몰랐습니다. 교회에서는 원천징수를 하지 않아서 사례비를 받으면 지급명세서를 세무서에 제출해야 하는데, 이를 놓치고 있었습니다. 또한, 종합소득세를 누락한 것으로 보이며, 이로 인해 무신고가산세나 납부불성실가산세가 부과될 수 있어 걱정입니다. 현재 어떤 조치를 취해야 할지 막막합니다. 교회에서는 연간 사례비를 40만원에서 50만원씩 12개월 또는 10개월 동안 지급하고, 이를 지급명세서에 작성해 제출했었습니다. 종합소득세를 신고할 때 얼마나 세금을 납부해야 하는지, 그리고 지금까지 누락된 경우 불이익이나 법적 문제가 발생할 수 있는지 궁금합니다. 어떤 조치를 취해야 하는지 조언 부탁드립니다. 감사합니다.