간이사업자 3.3% 공제 후 매출에 포함되는가요?

세금계산서를 발급받지 않는 간이사업자입니다. 최근에는 일반 사업자에서 간이사업자로 변경했습니다. 이전 거래처에서는 세금계산서를 발급받지 않아 3.3%를 공제해준다고 합니다. 이 경우에는 제가 받는 돈이 사업자 매출로 인정되지 않는 걸까요? 사업자 매출에 포함되어야 내년에 매출이 4800만원 이상이 되어 세금계산서를 발급받을 수 있는 간이사업자로 전환될 수 있는데, 이를 방지할 방법이 있을까요?