연말정산 업무와 부서관리자 기능 관련 질문

연말정산 업무를 맡게 되어 부서관리자 기능을 알게 되었는데, 회사 고유 아이디와 부서관리자 아이디를 따로 만들었습니다. 각각의 아이디로 로그인해서 처리하려고 했는데, 연말정산이 각각 제출되는 것 같습니다. 제가 기대한 것과는 조금 다른데, 연말정산 등록과 금액처리를 하나로 묶어서 제출하는 것이 맞나요? 확인 부탁드립니다.