의료비 본인부담상한제 신청 후 연말정산 의료비 공제 가능한가요?

한 해 전, 아버지가 84세에 폐에 물차는 증상으로 종합병원에 입원하셨습니다. 그 후 퇴원하셨지만 11월에 다시 입원하셨고 암 진단을 받았습니다. 이로 인해 약 600만원의 의료비가 발생했는데, 최근 의료비 본인부담상한제에 대해 알게 되어 건강보험공단에 신청했습니다. 심사와 비용 지급까지 3~4개월이 소요된다고 합니다.

연말정산 시 아버지를 가족 공제로 포함하고 의료비 공제를 받고 싶지만, 의료비 공제와 본인부담상한제가 어떻게 연관되는지 궁금합니다. 본인부담상한제가 연말정산에 영향을 미칠 경우, 의료비 공제를 받지 않을 생각입니다. 두 가지 혜택을 동시에 받을 수 있다면 좋겠지만, 현재 가계 부담이 크기 때문에 선택을 해야 할 것 같습니다. 이에 대해 잘 아시는 분의 답변을 부탁드립니다.