현금영수증 발급 관련 문제

공부방을 운영하며 카드와 현금을 모두 받는데, 현금 결제 시에는 꼭 현금영수증을 발급해 드리고 있습니다. 최근에는 카드결제로도 현금영수증을 발급할 수 있다는 사실을 알게 되어 그렇게 진행했는데, 학부모 중 한 분께서 현금영수증이 발급되지 않았다는 내용으로 연락을 주셨습니다. 카드결제로 발급한 현금영수증은 카드 매출 내역 홈페이지에서 확인할 수 있지만, 홈택스에서는 확인이 되지 않는 것으로 보입니다. 두 경우가 서로 다른 것일까요?