입사한 달부터 받은 실손보험금이 의료비를 초과하면, 해당 의료비는 연말정산에서 공제받지 못하고 실손보험금을 제외하고 신고해야 합니다. 실손보험금이 의료비보다 많으면 공제대상 의료비에서 차감되어야 하며, 회사 프로그램에 입력이 안 되는 것은 이 때문입니다. 의료비를 제외하고 처리하면 해당 부분은 공제를 받을 수 없지만, 잘못 신고하여 추후 세무조사나 과태료 부과 위험은 줄어듭니다. 연말정산 시 실손보험금 수령액이 의료비보다 많을 경우, 의료비 공제액은 0으로 처리하는 게 원칙이에요. 따라서 의료비를 제외하고 신고해야 하며, 이후 추가적인 증빙이나 수정 신고가 필요하지 않습니다.