연말정산 세액공제 자료 제출 관련 질문

홈택스에서 가족의 보험료, 의료비, 신용카드 등의 자료를 조회할 수 있지만, 이를 연말정산 자료로 제출해도 괜찮을까요? 국세청에서 자동으로 제외하고 계산해 주는 건가요? 아니면 별도로 다운로드하지 말고 직접 제출해야 할까요?